¶ 🧬 Genomicon Allele Tm Analyzer
Калькулятор селективности аллель-специфических праймеров
v1.0
¶ 📋 Основные параметры
| Название | Послед-сть (5'→3') | Матрица (5'→3') | Длина | GC% | Tm (°C) | Ta (°C) |
|---|
¶ 📊 Расширенные параметры
| Название | MW (g/mol) | Ext. Coeff (M⁻¹cm⁻¹) | nmole/OD260 | µg/OD260 |
|---|
Назначение:
Онлай-инструмент для расчета температуры плавления () праймера c учетом одиночной замены (только один SNP). Расчет учитывает влияние конкретного миссматча на термодинамику дуплекса в заданных буферных условиях ПЦР.
¶ 🔬 Основные параметры
- Длина — Общее количество нуклеотидов.
- GC% (GC Content) — Содержание G и C (%). Доля гуанина и цитозина в последовательности.
- Tm (Melting Temperature) — Температура плавления. Температура, при которой 50% ДНК находится в двухцепочечном состоянии.
- Ta (Annealing Temperature) — Температура отжига. Рекомендуемая температура для ПЦР.
¶ 📊 Расширенные параметры
- MW (Molecular Weight) — Молекулярный вес (g/mol). Масса одного моля олигонуклеотида.
- Ext. Coeff (Extinction Coefficient) — Экстинкционный коэффициент (M⁻¹cm⁻¹). Показывает, сколько света поглощает раствор при 260 нм.
- nmole/OD₂₆₀ — Наномоль на единицу OD. Количество олиго в наномолях, дающее поглощение 1 OD.
- µg/OD₂₆₀ — Микрограмм на единицу OD. Масса олиго в микрограммах, дающая поглощение 1 OD.
¶ Сведения о калибровке по буферу
- ✅ Значение экспериментально подтверждено; расчет откалиброван по буферным системам производителей с применением метода Owczarzy et al. 2018.
- Без галочки Значение рассчитано математически; экспериментальная проверка и калибровка не проводились.
¶ Ваш бренд в статусе ✅ VALIDATED
Мы приглашаем производителей реагентов и лаборатории к партнерству для проведения экспериментальной валидации ваших систем. По результатам тестов калибровки будут интегрированы в общую базу.
Справочная информация
Теоретическая база, алгоритмы расчета и используемые константы подробно описаны в разделе:
Методология и расчетные модели Genomicon Oligo Analyzer
¶ Как цитировать
Sleptcov A. Genomicon Allele Tm Analyzer: Allele-Specific Stability Analysis (v1.0). Zenodo. 2026. DOI: 10.5281/zenodo.19759086. (Accessed: ).
